Superman sur Game Boy est un défilement latéral 2D peu spectaculaire composé de dix mondes. Vous n'avez accès à aucun des pouvoirs de Superman, à l'exception du vol qui remplace le saut. La plupart des niveaux de jeux sont des niveaux de défilement de base où vous vous déplacez simplement dans l'environnement en attaquant les ennemis jusqu'à ce que vous atteigniez l'objectif final. D'autres types de niveaux vous ont dans une perspective de défilement fixe similaire aux niveaux de vol dans la mort et le retour de Superman, mais là où ce jeu a adopté un nouvel ensemble de contrôles, ce jeu colle à la disposition des niveaux principaux. Vous maintenez le bouton A pour garder Superman dans l'air en évitant les ennemis et le bas de l'écran parce que c'est une mise à mort instantanée si vous tournez trop bas. Enfin, vous vous retrouverez sous l'eau dans deux zones où les commandes restent à nouveau les mêmes.